Veel FlowParts, zoals subroutines en loops, kunnen zelf ook weer code bevatten. Na het creëren van een dergelijke container, kunt u daaraan weer FlowParts toevoegen door ze er simpel naar de container toe te verslepen. De container wordt dan gemarkeerd om aan te geven dat het de nieuwe parent van de FlowPart is geworden.

De container is verantwoordelijk voor de daarin geneste FlowParts. Als de expand knop niet is ingedrukt, zijn alle FlowParts daarin verborgen - en op dezelfde manier, komt de inhoud weer zichtbaar als u op de expand knop drukt. Tussen Flowparts in verschillende containers kunt u geen verbindingen maken en de inhoud van een container wordt bij een verplaatsing van de container mee verplaatst.