O Kompare torna a tarefa de aplicação e anulação das diferenças tão simples como 'apontar e clicar'. Você poderá efetuar várias operações de aplicação e anulação de diferenças, uma vez que todas as operações são efetuadas em memória e não são gravadas nos arquivos em disco, até que a operação de gravação seja efetuada.
Para aplicar uma diferença, clique na região realçada da diferença, selecionando depois a opção → (Espaço).
Para cancelar a aplicação de uma diferença, clique na região previamente selecionada para aplicação e escolha depois a opção → (Backspace).
Depois de rever as diferenças entre arquivos e de ter considerado todas as diferenças aceitáveis, é possível aplicá-las todas com uma única operação, selecionando a opção → (Ctrl+A).
Para reverter todas as diferenças que tenham sido aplicadas, selecione a opção → (Ctrl+U).