Molte FlowPart, come le subroutine ed i cicli, possono contenere del codice. Dopo aver creato tale contenitore, le FlowPart possono essere aggiunte mediante trascinamento nel contenitore; questo sarà evidenziato per indicare che diventerà il nuovo genitore della FlowPart.

Il contenitore si prende la responsabilità delle FlowPart annidate al suo interno. Se non si è fatto clic sul pulsante di espansione tutte le FlowPart saranno nascoste, e allo stesso modo i contenuti saranno mostrati quando si farà nuovamente clic su tale pulsante. Le connessioni non possono essere fatte tra FlowPart che si trovano in contenitori diversi, inoltre il contenuto di un contenitore verrà spostato insieme al contenitore.