Ви можете виконати пошук текстового рядка у будь-якому з вікон KDiff3. За допомогою пункту меню Зміни → Пошук... (клавіатурне скорочення Ctrl+F) можна відкрити діалогове вікно, у якому ви зможете вказати рядок, який ви шукаєте. Крім того, ви можете вказати вікна, у яких відбуватиметься пошук. Пошук завжди виконуватиметься від початку даних. Для переходу до наступного знайденого рядка можна скористатися пунктом меню Зміни → Знайти далі... menu item (F3). Якщо пошук виконуватиметься у декількох вікнах, спочатку буде вказано варіанти у першому вікні, згори до низу, потім у другому вікні тощо.