Weil mehrere Dateien auszuwählen sind, hat KDiff3 einen besonderen Dialog zum Öffnen von Dateien:

Der Dateidialog ermöglicht die manuelle Eingabe von Dateinamen, die Auswahl über den Datei-Browser (Datei...) oder das Auswählen einer zuletzt geöffneten Datei aus dem Auswahlfeld. Der Dateidialog merkt sich Ihre Auswahl und zeigt sie beim nächsten Mal wieder an. Sie müssen keine dritte Datei angeben, wenn Sie den Eintrag für C leer lassen, wird die Analyse der Unterschiede mit zwei Dateien durchgeführt.

Über den Knopf Ordner... können Sie auch einen Ordner auswählen. Wenn Sie einen Ordner wählen, wird das Vergleichen bzw. Zusammenführen von Ordnern eingeleitet. Wenn für A eine Datei ausgewählt wird, für B und C jedoch ein Ordner, dann benutzt KDiff3 den Dateinamen aus A in den beiden anderen Ordnern.

Wenn Zusammenführen angekreuzt ist, wird das Eingabefeld für Ausgabe aktiv und lässt sich bearbeiten. Es ist allerdings nicht unbedingt erforderlich, sofort eine Ausgabedatei festzulegen. Sie können diesen Schritt auch später beim Speichern erledigen.

Der Knopf Einrichten öffnet einen Dialog mit Einstellungen. Hier können Sie Optionen festlegen bevor Sie mit dem Vergleichen/Zusammenführen beginnen.