Podeu cercar una cadena en qualsevol finestra de text del KDiff3. L'element de menú Edita → Cerca... (Ctrl+F) obre un diàleg que permetrà especificar la cadena a cercar. També podreu seleccionar les finestres on s'ha de cercar. Sempre es començarà a cercar per la part superior. Utilitzeu l'element de menú Edita → Cerca la següent... (F3) per a passar a la següent ocurrència. Si seleccioneu cercar a diverses finestres, se cercarà des de la primera finestra de dalt a baix abans que es comenci la cerca de nou a la següent finestra a la part superior, etc.