Iniciar a Comparação ou Junção de DirectoriaIsto é bastante semelhante à junção e comparação simples com ficheiros únicos. O utilizador apenas terá de indicar nomes de pastas na linha de comandos ou na janela de abertura de ficheiros.
kdiff3pasta1 pasta2kdiff3pasta1 pasta2-odestino
Se não for indicada nenhuma pasta de destino, então o KDiff3 irá usar a pasta2.
kdiff3pasta1 pasta2 pasta3kdiff3pasta1 pasta2 pasta3-odestino
Quando forem reunidas três pastas, então a pasta1 será usada como a base para a junção. Se não for indicada nenhuma pasta de destino, então o KDiff3 irá usar a pasta3 como pasta de destino para a junção.
Repare que só a comparação é que começa automaticamente, não a junção. Para tal, terá de seleccionar primeiro um item do menu ou a tecla F7. (Mais detalhes posteriormente.)