O Explorador de Projetos é o componente principal do LabPlot, destinado a lidar com seus objetos. Os mesmos são organizados em uma estrutura em árvore que representa as relações pai-filho entre os diferentes objetos. As pastas e subpastas podem introduzir um agrupamento adicional para os diferentes objetos.

O explorador de projetos é uma janela acoplável e poderá ser colocada em qualquer local. O usuário poderá determinar quais as colunas que devem ser apresentadas, marcando/desmarcando as colunas de interesse no menu de contexto (clique com o botão direito do mouse em um local vazio da árvore ou no seu cabeçalho). Além disso, a lista de objetos apresentados poderá ser reduzida se usar o filtro do campo de texto Pesquisar/Filtrar.