Текущая версия приложения всплывающих заметок KNotes не позволяет запретить показ заметок в переключателе рабочих столов. Этот недостаток легко исправить с помощью правила.
Если открыто окно заметки:
Нажмите кнопку Определить свойства окна и выберите любое окно заметки. Задайте соответствие только по главному имени класса, оставив флажки неотмеченными (дополнительные сведения доступны в разделе Выбор окон):

Нажмите кнопку ОК, чтобы заполнить поля вкладки Выбор окон свойствами выбранного окна. Введите информативный текст в поле Описание:

Включите атрибут Не показывать в переключателе рабочих столов с параметром Принудительно:

Нажмите кнопку «ОК», чтобы завершить ввод правила.