O Kalzium tem muitas opções de configuração, a que poderá aceder se abrir a janela do menu Configuração, na opção .
Na página de Esquemas, poderá alterar as diferentes cores para cada esquema.
Em vez de usar um gradiente linear para mostrar a propriedade indicada de um elemento na tabela periódica, o Kalzium também pode usar um gradiente logarítmico.
Na página de Gradientes, poderá alterar as propriedades que deseja mostrar com um gradiente logarítmico.
Também poderá escolher a Cor do Valor Máximo e a Cor do Valor Mínimo do gradiente.
Na página de Unidades, poderá seleccionar as unidades. Poderá seleccionar se prefere 'kJ/mol' (quilo-joules por mole), 'J/mol' (joules por mole) ou se prefere 'eV' (electrão-volt). Para os tamanhos, defina a unidade por omissão em picómetros (pm), nanómetros (nm) ou Ångström (Å). A temperatura está em Kelvin por omissão, mas poderá mudar para graus Celsius (centígrados ou °C), Fahrenheit (°F) ou Réaumur (°Ré).
Na página de Calculadora, poderá configurar as calculadoras do Kalzium.