CVS käsitleb katalooge põhimõtteliselt täiesti erinevalt tavalistest failidest. Need ei allu versioonide kontrollile, st. sul ei ole võimalik määrata, millised kataloogid olid projektis teatud ajahetkel olemas. Lisaks sellele ei saa katalooge otseselt eemaldada, kui sa just neid vahetult hoidlast ei kõrvalda.
CVS järgib tava, et kataloog on projekti versioonis "olematu", kui see on tühi. Seda saab teostada võtme -P
lisamisega käsule cvs update ja cvs checkout. Selle võimaluse saab kehtestada menüükäsuga → .
Kataloogi saab lisada hoidlasse menüükäsuga → või hiire parema nupuga märgitud kataloogil klõpsates ja ilmuvast kontekstimenüüst kirjet valides. Arvesta, et erinevalt failide lisamisest ei nõua kataloogi lisamine hilisemat sissekannet. Cervisia annab seejärel käsu
cvs add kataloogi_nimi