Konfiguracja Kalzium Kalzium posiada wiele opcji konfiguracyjnych, do których masz dostęp poprzez menu → .
Na karcie Kolory możesz ustawić różne kolory dla każdego schematu.
Na karcie Jednostki możesz wybrać jednostki. Możesz wybierać pomiędzy domyślną jednostką kJ/mol, a eV. Temperatura jest pokazywana domyślnie w stopniach Kelvina, ale możesz ją pokazać w stopniach Celsjusza lub Fahrenheita.
Na karcie Różne można ustawić wyświetlanie masy atomowej pierwiastków lub tylko numeru w układzie okresowym.